環(huán)境微生物群落分析的T-RFLP技術(shù)及其優(yōu)化措施

末端限制性酶切片段長(zhǎng)度多態(tài)性分析(terminal restriction fragment length polymorphism, T-RFLP)是近年來發(fā)展起來的、不依賴于培養(yǎng)的微生物群落分析方法之一.由于其在微生物群落結(jié)構(gòu)分析方面的特點(diǎn),包括分辨率高、易于實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化及互聯(lián)網(wǎng)海量數(shù)據(jù)共享等優(yōu)勢(shì),自1997年最先被報(bào)道以來得到了廣泛的應(yīng)用,成為環(huán)境微生物群落分析的最強(qiáng)有力的工具之一.本文詳細(xì)介紹了T-RFLP技術(shù)的原理,并從環(huán)境樣品群落DNA的提取、引物設(shè)計(jì)和PCR擴(kuò)增、限制性酶切、電泳分離檢測(cè)和T-RFLP圖譜解析等5個(gè)方面討論了用該技術(shù)解析環(huán)境微生物群落的方法和技巧,簡(jiǎn)述了近8 a來國(guó)外T-RFLP技術(shù)在群落分析中的研究進(jìn)展.類似于其他的分子微生物生態(tài)學(xué)技術(shù), T-RFLP也有自身的缺陷,因此重點(diǎn)分析了該技術(shù)的局限性及相應(yīng)的解決辦法. 圖2 表1 參62

作 者： 余素林 吳曉磊 錢易 YU Sulin WU Xiaolei QIAN Yi   作者單位： 清華大學(xué)環(huán)境科學(xué)與工程系/環(huán)境模擬與污染控制國(guó)家重點(diǎn)聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室,北京,100084  刊 名： 應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報(bào)  ISTIC PKU 英文刊名： CHINESE JOURNAL OF APPLIED & ENVIRONMENTAL BIOLOGY  年，卷(期)： 2006 12(6)  分類號(hào)： Q93  關(guān)鍵詞： 微生物群落   末端限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性分析(T-RFLP)   分子微生物生態(tài)學(xué)   生物多樣性  

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