五種/株原甲藻核糖體小亞基(18S rRNA)基因克隆及序列分析

采用分子克隆及序列比對(duì)的方法,對(duì)五種/株赤潮原甲藻18S rRNA基因全長(zhǎng)序列進(jìn)行擴(kuò)增、克隆和序列測(cè)定,并從GenBank上下載13個(gè)原甲藻18S rRNA基因接近全長(zhǎng)的序列,用NJ法和ME法構(gòu)建了原甲藻屬的系統(tǒng)樹(shù).結(jié)果表明,五種/株原甲藻18S rRNA基因擴(kuò)增序列長(zhǎng)度為1782-1783bp,其中來(lái)自南海(中國(guó)海域)和來(lái)自美國(guó)海域的兩株微小原甲藻(Prorocentrum minimum)的序列完全一致;東海的赤潮原甲藻(Prorocentrum sp.)與具齒原甲藻(P.dentatum)的序列也完全一致,與微小原甲藻只有5個(gè)堿基的差異;而海洋原甲藻(P.micans)與微小原甲藻和具齒原甲藻的序列差異較大,分別為27個(gè)和28個(gè)堿基.通過(guò)NJ法和ME法構(gòu)建的系統(tǒng)樹(shù)基本一致.由系統(tǒng)樹(shù)可以看到:原甲藻屬大致分為兩支,本實(shí)驗(yàn)的微藻全部分布在同一支上.18S rRNA基因序列還將有助于有害赤潮藻快速鑒定的特異性分子探針的研制.

作 者： 王波 米鐵柱 呂頌輝 孫軍 李秀芹 甄毓 李榮秀 于志剛 WANG Bo MI Tie-Zhu L(U) Song-Hui SUN Jun LI Xiu-Qin ZHEN Yu LI Rong-Xiu YU Zhi-Gang   作者單位： 王波,米鐵柱,李秀芹,甄毓,于志剛,WANG Bo,MI Tie-Zhu,LI Xiu-Qin,ZHEN Yu,YU Zhi-Gang(中國(guó)海洋大學(xué),青島,266003)

呂頌輝,L(U) Song-Hui(暨南大學(xué)水生生物研究所,廣州,510632)

孫軍,SUN Jun(中國(guó)科學(xué)院海洋研究所,青島,266071)

李榮秀,LI Rong-Xiu(上海交通大學(xué),上海,200030) 

刊 名： 海洋與湖沼  ISTIC PKU 英文刊名： OCEANOLOGIA ET LIMNOLOGIA SINICA  年，卷(期)： 2006 37(5)  分類號(hào)： Q93  關(guān)鍵詞： 原甲藻屬   18SrRNA基因   系統(tǒng)分析  

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