人類群體遺傳結(jié)構(gòu)的雙標(biāo)圖模型及其應(yīng)用

提出了分析人類群體遺傳結(jié)構(gòu)的PPG雙標(biāo)圖模型的基本原理及其應(yīng)用.PPG雙標(biāo)圖根據(jù)人類群體遺傳學(xué)的基本原理,利用矩陣奇異值分解技術(shù),將多維基因頻率矩陣近似為一個能夠用雙標(biāo)圖表示的二維矩陣,從而實現(xiàn)了人類群體遺傳結(jié)構(gòu)的圖形化和可視化直觀分析.它與聚類分析、主成分分析、對應(yīng)分析等傳統(tǒng)多元統(tǒng)計分析方法相比,具有明顯的優(yōu)越性.PPG雙標(biāo)圖通過其幾何性質(zhì),反映了其豐富的群體遺傳學(xué)含義;更重要的是,在基因頻率矩陣前2項奇異值的累計貢獻率足夠大的前提下,利用雙標(biāo)圖,以輔助線為補充,可以實現(xiàn)人類群體遺傳結(jié)構(gòu)的可視化直觀定量分析:①比較各群體之間的遺傳距離,劃分群體類型;②比較各基因的變異性大小;③分析各基因之間的相關(guān)性;④比較某基因?qū)Ω鱽喨后w遺傳結(jié)構(gòu)的相對貢獻;⑤比較任意2個亞群體遺傳結(jié)構(gòu)的差異;⑥分析任意2個基因的差異及其對各亞群體變異性的貢獻;⑦分析群體與基因的交互作用及其對群體亞分的貢獻.因此,PPG雙標(biāo)圖值得在人類群體遺傳結(jié)構(gòu)分析中推廣應(yīng)用,但PPG雙標(biāo)圖也存在一定的局限性.

作 者： 薛付忠 王潔貞 郭亦壽 胡平 XUE Fu-zhong WANG Jie-zhen GUO Yi-shou HU Ping   作者單位： 薛付忠,王潔貞,胡平,XUE Fu-zhong,WANG Jie-zhen,HU Ping(山東大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院流行病學(xué)與醫(yī)學(xué)統(tǒng)計學(xué)研究所,濟南,250012)

郭亦壽,GUO Yi-shou(山東大學(xué)醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)研究所,濟南,250012) 

刊 名： 科技導(dǎo)報  ISTIC PKU 英文刊名： SCIENCE & TECHNOLOGY REVIEW  年，卷(期)： 2006 24(5)  分類號： Q347 R394.5  關(guān)鍵詞： 人類群體遺傳結(jié)構(gòu)   PPG雙標(biāo)圖模型   HLA-A基因座   漢族群體  

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