瀕危植物核心種質(zhì)取樣比率的蒙特卡羅模擬研究

針對瀕危植物明黨參ISSR數(shù)據(jù)以及八角蓮和夏蠟梅的等位酶數(shù)據(jù),以多態(tài)位點數(shù)(A)、多態(tài)位點百分?jǐn)?shù)(PPB)、居群內(nèi)基因多樣度(Hs)、群體總的基因多樣度(Ht)、基因分化系數(shù)(Gst)以及捕獲的基因位點數(shù)為主要遺傳多樣性指標(biāo),利用蒙特卡羅模擬抽樣法在各抽樣比例下重復(fù)抽樣1000次,并構(gòu)建了3個植物群體的基因捕獲曲線與基因增量曲線.通過兩種曲線的比較分析確定這3種瀕危植物的最佳取樣比例皆為25%,但這并不意味著其他植物的最佳抽樣比也為25%.此時明黨參的多態(tài)位點數(shù)為163,多態(tài)位點百分?jǐn)?shù)為40.85%,基因多樣度為0.2744;八角蓮的多態(tài)位點數(shù)為12,多態(tài)位點百分?jǐn)?shù)為32.43%,基因雜合度為0.1943;夏蠟梅的多態(tài)位點數(shù)為10,多態(tài)位點百分?jǐn)?shù)為25%,基因雜合度為0.0638,其各項遺傳多樣性指標(biāo)與保護總?cè)后w95%遺傳信息的樣本非常相近.這說明通過蒙特卡羅模擬抽樣與基因捕獲及增量曲線綜合分析確定核心種質(zhì)的最佳抽樣比例客觀合理、切實可行.

作 者： 李正宏 邱英雄 徐海明 葉倩 傅承新 LI Zheng-hong QIU Ying-xiong XU Hai-ming YE Qian FU Cheng-xin   作者單位： 李正宏,邱英雄,葉倩,傅承新,LI Zheng-hong,QIU Ying-xiong,YE Qian,FU Cheng-xin(浙江大學(xué),生命科學(xué)學(xué)院,植物系統(tǒng)進(jìn)化與生物多樣性實驗室,浙江,杭州,310029)

徐海明,XU Hai-ming(浙江大學(xué),農(nóng)學(xué)系,浙江,杭州,310029) 

刊 名： 浙江大學(xué)學(xué)報（農(nóng)業(yè)與生命科學(xué)版）  ISTIC PKU 英文刊名： JOURNAL OF ZHEJIANG UNIVERSITY(AGRICULTURE & LIFE SCIENCES)  年，卷(期)： 2006 32(4)  分類號： Q943  關(guān)鍵詞： 蒙特卡羅模擬   取樣策略   遺傳多樣性   基因捕獲曲線   基因增量曲線  

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