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基于玉米綜合QTL圖譜的比較分析及株高QTL的統(tǒng)合分析
以高密度遺傳圖IBM2 Neighbors整合公開(kāi)發(fā)表的、控制68個(gè)性狀的1201個(gè)玉米QTL,構(gòu)建了用于分子標(biāo)記發(fā)掘、QTL定位、基因克隆及分子標(biāo)記輔助選擇的綜合圖譜,并將結(jié)果融入本地化數(shù)據(jù)庫(kù)CMap軟件.利用CMap比較玉米QTL綜合圖和水稻QTL圖譜發(fā)現(xiàn),玉米和水稻QTL成簇分布具有普遍性;22個(gè)玉米株高QTL與64個(gè)水稻株高QTL位于標(biāo)記水平上的共線性區(qū)域,43個(gè)玉米產(chǎn)量QTL與7個(gè)水稻QTL位于標(biāo)記水平上的共線性區(qū)域.以控制玉米株高的QTL為例,利用overview的分析方法對(duì)127個(gè)QTL進(jìn)行優(yōu)化,定位了40個(gè)"真實(shí)"QTL,提高了QTL定位的準(zhǔn)確性和有效性,發(fā)現(xiàn)了玉米和水稻株高相關(guān)QTG(quantitative trait gene)的候選基因.本研究為大量玉米QTL信息的有效利用搭建了重要的生物信息學(xué)平臺(tái).
